Закидываешь пачку fb2 на компе в "папка.синхронизации/IN/", программа их синхронизирует с облаком, в облаке они каталогизируются в базу (для веб-интерфейса) и синхронизируются обратно на комп, но уже со структурой папок в соответствии с заданными настройками, скажем: "папка.синхронизации/по.авторам" или "папка.синхронизации/по.жанрам/по.автора
Или такое уже есть, а я не знаю? Имхо, своя аудитория у такого сервиса будет.